Choroby, w których układ odpornościowy, naturalnie mających na celu ochronę ciała obcego z najeźdźcami, takich jak wirusy i bakterie, zamiast protestuje przeciwko i powoduje uszkodzenia zdrowych tkanek organizmu. Układ odpornościowy jest złożonym w organizmie, który służy normalnie do "seek and destroy" najeźdźców ciała, w tym czynników zakaźnych. Pacjentów z autoimmunologicznych chorób często mają niezwykłe przeciwciał krążących we krwi, które zwalczają własnych tkanek organizmu.

Przykłady chorób autoimmunologicznych to toczeń rumieniowaty układowy, zespół Sjögrena, Zapalenie tarczycy Hashimoto, Reumatoidalne zapalenie stawów, diabetyków (typ 1), zapalenie wielomięśniowe, twardzina, Addison choroby, bielactwo, niedokrwistość złośliwą, kłębuszkowe zapalenie nerek i włóknienie płuc.

Choroby autoimmunologiczne są częstsze u kobiet niż u mężczyzn. Uważa się, że kobiety estrogenów może mieć wpływ na układ odpornościowy do predysponują niektóre kobiety do chorób autoimmunologicznych. Ponadto, obecność jednego autoimmunologiczne choroby zwiększa szansę dla rozwoju innego jednoczesne choroby autoimmunologiczne.