Państwie, w którym układ odpornościowy nie działa prawidłowo i jej funkcje ochronne są nieodpowiednie. Pacjent jest bardziej podatny zakażeń, w tym od bakterii, które są zwykle nie zakaźnych (zobacz oportunistyczne zakażenia). To może wystąpić w wyniku intensywnej chemioterapii i radioterapii, zwłaszcza odnośnie do przygotowanie pacjenta do przeszczepów. Również może wystąpić z powodu stanach chorobowych. Zakażenia ludzkim wirusem niedoboru odporności może prowadzić do immunosupresji. Graft versus host choroby tworzy stan immunosupresyjne, w tym układu immunologicznego ochrony przed zakażeniem jest niewystarczająca. w przeszczepu pacjent, leczenia i poważne graft versus host choroby można połączyć aby umożliwić przytłaczające zakażenia.