Mikroskopia fluorescencji jest jednym z najbardziej zaawansowanych i szeroko stosowany imaging technik badań biologicznych, ponieważ można wizualizować procesy dynamiczne wewnątrz żywych komórek z wyśmienite czułości i specyficzności. Główne breakthroughs obejmowały rozwój Mikroskop konfokalny w latach osiemdziesiątych i mikroskopowe dwu foton w latach dziewięćdziesiątych. Mają zaliczki te zostały towarzyszy przełomowe ulepszeń w możliwość wizualizacji białek szczególnych i organelles wewnątrz żywych komórek fluorescencyjnych białek (na przykład, Zielone białko fluoryzujące (zwykłej dobrej praktyki rolniczej)) i technologii transgenicznych. Ponadto ogromny wzrost mocy obliczeniowej umożliwiły nabycia i analizę dużych obrazów zbiorów danych i w ten sposób dalsze mają ułatwione ascendancy mikroskopia fluorescencji.